[spoiler]
Для указания даты, начиная с которой программа будет формировать новый счет фактуру необходимо перейти по пути:
"Предприятие" -> "Настройка параметров учета" -> "НДС"
и указать флажок и дату.
Пункт "НДС" может быть недоступен для случая с упрощенкой:
В этом случае наиболее простой вариант временно включить пункт "Все системы налогообложения", установить дату, и вернуть упрощенку.